別のphpファイルを読み込んで表示させるには <?php include("xxxx.php"); ?>といった具合に
記述しますが、cgiをこれで呼ぶとファイルのソースが表示されcgiを実行してくれません。
そこでgoogleで調べた結果なんとか解決できたので自分用の備忘録として残しておくことにします。

 <?php readfile("URL/xxxx.cgi"); ?>

といった具合に記述すると、cgiを実行してくれるようです・・・